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mg132前沿信息_mg132在泛素实验的作用(2024年12月实时热点)

内容来源:惠生活优选所属栏目:教程更新日期:2024-12-04

mg132

CHX+MG132,追踪蛋白降解 大家好,今天我想和大家分享一下我最近在做的一个实验——用CHX和MG132来追踪底物蛋白的降解。这个实验虽然有点复杂,但真的很有趣,让我对蛋白质降解的机制有了更深的理解。 CHX和MG132的基本概念 𐟌🊊首先,让我们来了解一下这两种药物。CHX(环乙酰亚胺)是一种常用的蛋白质合成抑制剂。它的作用机理是阻止真核生物核糖体的转位,从而停止蛋白质的合成。CHX在研究蛋白质降解、半衰期和转化率方面非常重要。 而MG132则是一种有效的、可逆的并且能渗透细胞20S蛋白酶体的抑制剂。它的作用是阻止蛋白质的降解,从而让我们能够观察到底物蛋白的降解动力学。 实验步骤 𐟧ꊊ好了,了解了这些基本概念后,我们来看看具体的实验步骤吧: 准备工作 首先,我们需要确保细胞在六孔板的密度达到70%以上,这样才能保证后续的Western blot(WB)分析能够顺利进行。 药物配制 接下来,我们需要配制药物。MG132的浓度是40,CHX的浓度是20/ml。如果你还想加入其他药物,记得明确剂量哦。 设置条件组 然后,我们需要设置好条件组。举个例子,我们可以设置以下几种条件:①CHX处理 ②CHX+MG132处理 ③CHX+目的药物处理 ④CHX+MG132+目的药物处理。 时间点收集 最后,我们在每个条件组中分别于0h、2h、4h、6h、8h、12h和24h收集细胞,并进行蛋白质提取。 实验结果 𐟓Š 通过这个实验,我们可以观察到不同时间点下,底物蛋白的降解情况。通过WB分析,我们可以看到蛋白质表达水平的变化,从而可视化蛋白质降解的动力学。 个人小结 𐟓 这个实验虽然有点繁琐,但真的很有价值。通过CHX和MG132的处理,我们可以更深入地了解蛋白质降解的机制。希望我的分享能对大家有所帮助! 如果你有任何问题或想法,欢迎在评论区留言哦!𐟘Š

第一步,预测分析ENO1和PD-L1之间的互作 基于AlphaFold2预测分析发现位于与PD-L1相互作用界面的ENO1的四个关键残基(N52、K54、K197和E250)(图2a-b)。 第二步,ENO1的E250介导与PD-L1相互作用 Co-IP分析发现E250突变为丙氨酸(E250A)显著降低了ENO1与PD-L1之间的相互作用(图2c)。另外,分析还发现ENO1的E250能够与PD-L1上的R125形成临界盐桥,从而增强相互作用的稳定性(图2a)。表明ENO1的E250在介导PD-L1相互作用中的重要作用。 第三步,ENO1上E250附近S249糖基化影响其与PD-L1相互作用 GST pulldown实验显示只有全长的ENO1和ENO1的C端区域(包含S249糖基化位点)显示出与PD-L1的结合信号(图2d)。提示靠近关键E250残基的S249上的大量糖基化修饰可能会破坏与PD-L1的相互作用。Co-IP分析发现,过表达WT ENO1明显减少PD-L1水平;而过表达S249A ENO1,且无论是否存在OGT过表达,PD-L1均无明显变化(图2e-f)。 Co-IP分析显示,过表达WT或T19A ENO1后,OGT过表达增加O-糖基化水平,但降低了ENO1与PD-L1互作,并伴有PD-L1蛋白水平的升高,而在过表达S249A ENO1的细胞中没有观察到这种作用(图2g-h)。类似的,TMG处理也增加了WT ENO1重组细胞中的PD-L1蛋白水平,但在S249A重组细胞中没有(图2i-j)。表明ENO1上E250附近S249糖基化抑制其与PD-L1互作,降低PD-L1的蛋白水平。 第四步,ENO1 S249 O-糖基化通过蛋白酶体降解途径抑制PD-L1的表达 Qpcr检测发现OGT的过表达并未改变PD-L1 mRNA水平,表明PD-L1的调控机制与转录无关(图2k)。分析PD-L1的半衰期,发现TMG可促进WT ENO1过表达细胞中PD-L1的稳定性,但对S249A ENO1过表达细胞无促进作用。此外,蛋白酶体抑制剂MG132,而不是溶酶体抑制剂氯喹(CQ)或自噬抑制剂3-甲基腺嘌呤(3-MA),挽救了S249A ENO1过表达细胞中PD-L1的降解(图2l),表明ENO1 S249 O-糖基化通过蛋白酶体降解途径抑制PD-L1的表达。 #科研日常# #糖基化##coip实验#

《Adv Sci》解读:circNOLC1如何增强PPP? ChIRP-MS和RNA pulldown-WB实验,发现AZGP1, DSG1和KRT16证明与circNOLC1存在互作(图1a-c)。因AZGP1在CRC中高表达,且在葡萄糖代谢中发挥重要作用,故将其作为研究对象。RIP实验发现circNOLC1在anti-AZGP1下拉物中显著富集(图1d)。为了确定circNOLC1与AZGP1互作区域,设计circNOLC1缺失突变体,进行RNA pulldown实验,表明circNOLC1的nt 91-150是circNOLC1与AZGP1相互作用必需的(图1e)。 进一步检测发现,circNOLC1仅调控AZGP1蛋白水平,用蛋白酶体抑制剂处理细胞显示MG132显著提高AZGP1蛋白水平,暗示circNOLC1阻碍AZGP1蛋白降解(图1f)。此外,功能回复实验结果表明circNOLC1通过AZGP1激活mTOR/SREBP/G6PD信号通路来增强PPP(图1g和h)。 文献解读全文分享可查阅:【《Adv Sci》解读:极为少见!CircNOLC1同时与AZGP1和miR-212-5p结合调控促进结直肠癌肝转移】。 基云专注互作机制研究,如有相关科研问题,欢迎留言探讨。 #科研#⠣研究生#⠣RIP实验#⠂ #CHIRP实验#⠣ RNA pulldown实验

第一步,确定调节YBX1表达的潜在机制---泛素-蛋白酶体降解途径 为了进一步确定调节YBX1表达的潜在机制,泛素-蛋白酶体降解途径和自噬-溶酶体途径是细胞内蛋白质降解的两种重要途径。用MG132、3MA和CQ处理原代神经元(3MA是一种广泛使用的抑制细胞自噬的抑制剂,可抑制III类PI3K;CQ通过增加酸性内体/溶酶体的pH值来破坏溶酶体功能;MG132是一种广泛使用的泛素-蛋白酶体降解途径抑制剂。),发现MG132处理后,YBX1的表达水平升高(图2a)。表明泛素-蛋白酶体降解途径可能是YBX1在神经元中的主要调节机制。 第二步,确定TRIM56与YBX1相互作用 IP-MS和分子对接分析显示,E3泛素连接酶TRIM56与YBX1强结合(图2b-e)。细胞水平内源性、外源性Co-IP实验证实TRIM56与YBX1相互作用(图2f-h)。另外,Co-IP实验分析发现,在SCI模型小鼠和OGD处理过的神经元中,TRIM56的表达及其与YBX1的结合均减少(图2i-j)。表明TRIM56与YBX1之间存在相互作用。 第三步,确定TRIM56与YBX1相互作用的结合区域 构建一系列截短的Myc标签YBX1载体,进行Co-IP实验,以确定YBX1 TRIM56特异性结合的区域。Co-IP结果显示,TRIM56仅与YBX1的M3(26-324)片段结合(图2k-l)。表明TRIM56与YBX1之间存在直接相互作用。 全文分享请查阅:【《Adv Sci》解读:泛凋亡!TRIM56调节YBX1泛素化降解,改善脊髓损伤中ZBP1介导的神经元PANoptosis】。 如有相关科研问题,欢迎留言探讨。 #科研#⠂ #泛素化修饰#⠂ #研究生日常#⠂ #实验室日常#

热门辅酶Q10推荐!快来看看哪款适合你 身体是革命的本钱,心𐟫€的保养也不能忽视。适当服用辅酶Q10可以帮助养护身体。辅酶Q10就像身体的能量,为身体充电。市面上辅酶Q10产品众多,宣传也五花八门,不知道如何选择?以下是我多年服用辅酶Q10的经验分享,希望能帮助大家找到适合自己的产品! ◆自然之宝辅酶Q10 辅酶Q10含量:200mg/1粒 剂型:软胶囊 特点:吸收性好,适合体质较弱的人、运动小白和短期熬夜党。 ◆万益蓝辅酶Q10 辅酶Q10含量:150mg/1粒 添加:20mg足量PQQ 其他成分:黑胡椒提取物 特点:辅酶吸收率提升至132%,适合需要提高辅酶吸收的人群。 ◆PoemCare辅酶Q10 辅酶Q10含量:100mg/1粒 添加:燕窝酸 特点:成分温和,容易被吸收,适合敏感人群。 ◆信心康乐辅酶Q10 辅酶Q10含量:200mg/1粒 剂型:小胶囊 特点:橄榄油基地油,安心不致敏,适合备孕期的准妈妈和准爸爸们。 这些产品中,万益蓝的辅酶含量适中且添加了足量PQQ,非常适合经常熬夜的人群。我每天随餐服用一粒,现在已经推荐给父母一起服用了。好好养护身体,才能更好地工作!

MG132在急性淋巴细胞白血病中的新突破

MYH10去泛素化SNAIL蛋白 为了明确MYH10在SOC细胞中的作用机制,利用Biogrid分析发现SNAIL是MYH10的候选作用蛋白。检测发现MYH10敲减仅下调SNAIL的蛋白水平(图1a-b)。CoIP实验发现MYH10与SNAIL互作(图1c)。MYH10是否通过抑制SNAIL的泛素化减少其降解呢?使用anti-SNAIL进行IP实验,使用anti-UBC进行WB检测,结果发现MYH10显著降低SNAIL的泛素化水平(图1d)。并且MYH10敲低能减少CHX和MG132处理的SOC细胞中SNAIL的稳定性(图1e)。表明MYH10与SNAIL互作,影响SNAIL蛋白的稳定性。 全文分享请查阅:【《Adv Sci》解读:泛素化机制还可以这样做!MYH10招募去泛素化酶USP45,抑制SNAIL泛素化降解,促进卵巢癌顺铂耐药】。 如有泛素相关科研问题,欢迎来询探讨。 #泛素化修饰#⠂ #WB#⠂ #coip实验#⠂ #文献#⠂ #实验代做#

如何确定下游的蛋白分子? 初步确定下游的蛋白分子 通过WB检测铁死亡相关蛋白,发现敲低显著降低GPX4蛋白的表达(图1a-b),但不影响其RNA水平(图1c)。同样抑制剂亦能降低GPX4的蛋白水平(图1d)。构建GPX4 WT及其酶促失活突变体U46S进行功能实验,证实过表达GPX4 WT蛋白在抑制RSL3诱导的铁死亡方面具有功能(图1e)。放线菌酮(CHX)试验表明,敲低USP8缩短GPX4蛋白的半衰期(图1f)。表明USP8可能作为一种去泛素化酶在翻译后水平调节GPX4的蛋白丰度。 蛋白酶体介导的降解系统和自噬-溶酶体系统是调控蛋白质稳态的两大系统。而实验表明蛋白酶体抑制剂MG132挽救了敲减USP8介导的GPX4不稳定,而溶酶体抑制剂巴弗洛霉素A1 (BafA1)和氯喹(CQ)则无此作用(图1g),表明USP8介导的GPX4稳态调节取决于蛋白酶体系统。 全文分享可查阅:【《PNAS》解读:去泛素化修饰-顺序渐进-刨根问底。去泛素化酶USP8靶向铁死亡提高肿瘤免疫治疗的机制】。 如有相关机制研究,欢迎留言探讨。 #科研#⠂ ⠣泛素化修饰#⠂ ⠣wb实验#⠂ ⠣实验外包#⠂ #研究生#

AKT如何调控其蛋白稳定性? 第一步,TRPML1是通过泛素蛋白酶体途径降解的 蛋白酶体抑制剂MG132以浓度依赖的方式增强TRPML1的蛋白丰度,而BafaA1对TRPML1没有影响,表明TRPML1是通过泛素蛋白酶体途径降解的(图1a)。 第二步,TrCP可能是TRPML1泛素化的主要E3连接酶 Co-IP实验显示,TrCP过表达上调TRPML1泛素化水平,TrCP 的失活体则不能(图1c);此外,下调TrCP可降低TRPML1泛素化水平(图1d)。另外,Co-IP分析发现,K48R泛素突变体破坏了TRPML1的多泛素化,而K63R突变体则没有。此外,TrCP过表达后,K48相关的TRPML1泛素化增加(图1e-f)。表明TRPML1主要通过K48连接泛素化。 综上,TrCP可能是TRPML1泛素化的主要E3连接酶,通过lys48连接的多泛素链对TRPML1进行蛋白酶体降解。 第三步,探索S343磷酸化对K48连接的泛素化和TRPML1蛋白酶体降解的影响 Co-IP实验发现,TRPML1-S343D激活突变体抑制了TRPML1与TrCP的互作,而S343A失活突变体促进了这种互作(图1g)。Co-IP还发现,S343D突变体抑制TRPML1的泛素化,而S343A失活突变体增强泛素化(图1h)。另外,TrCP敲除延长了TRPML1-S343A的半衰期(图1i),表明S343磷酸化抑制了TrCP介导的K48泛素化和TRPML1的蛋白酶体降解。 第四步,确定TRPML1中哪些赖氨酸残基可能被泛素化 采用预测系统软件预测TRPML1的潜在泛素化位点,包括K55、K59、K62、K65、K219、K224、K227、K378和K552。构建野生型和潜在泛素化位点失活突变体【备注:泛素化失活突变体,赖氨酸(K)转精氨酸(R)】,进行Co-IP分析。发现K552R突变抑制了TRPML1的K48连锁泛素化(图1j),表明TRPML1K552位点泛素化;另外,TrCP无法促进TRPML1-K552R泛素化(图1k)。CHX脉冲追踪实验发现外源表达的TRPML1-K552R在CHX处理后比野生型TRPML1更稳定(图1l)。 表明AKT通过直接磷酸化TRPML1的Ser343位点,抑制K552泛素化和TRPML1的蛋白酶体降解,从而增强溶酶体胞吐作用。 #科研#⠂ #磷酸化#⠂ #泛素化#

分子互作蛋白调控目的蛋白IPTKB的分子机制 TRIM25是一种泛素连接酶,是否参与调控ITPKB蛋白稳定性积累呢? 证据1:研究人员发现敲低Trim25,显著增加ITPKB蛋白积累;Trim25过表达则相反抑制其积累(图1a-b)。 证据2:加入蛋白酶体抑制剂MG132后,Trim25过表达诱导的ITPKB水平降低效应被逆转(图1c),表明Trim25通过蛋白酶体途径降低ITPKB的稳定性。 证据3:采用放线菌酮(CHX)追逐实验,发现Trim25敲低增加ITPKB蛋白的半衰期,Trim25过表达则相反(图1d-e)。 证据4:耐药细胞内源Co-IP分析显示Trim25敲低显著降低ITPKB的多泛素化(图1f)。外源Co-IP分析,Trim25过表达增加ITPKB多泛素化(图1g)。 证据5:泛素化修饰类型研究。研究人员分别用Ub-K48、Ub-K63进行Co-IP泛素化分析,表明ITPKB被Ub-K48广泛泛素化(图1h);用Ub-K48、Ub-K48R进行Co-IP泛素化分析,表明Ub-K48R组的ITPKB多泛素化被消除(图1i)。表明Trim25介导ITPKB的K48链泛素化。 证据6:ITPKB泛素化修饰位点确认。网站预测ITPKB的K793和K818可能是Trim25结合域附近的潜在泛素化位点。构建ITPKB的K793R、K818R和2KR突变体,Co-IP分析单位点突变(K793R或K818R)对多泛素化没有影响,两个位点突变2KR消除ITPKB中K48链的多泛素化(图1j-k)。细胞实验也显示ITPKB野生型(而不是2KR突变型)增加细胞的存活率和ROS的降低(图1l-m)。 这些结果表明:TRIM25通过泛素修饰系统,参与ITPKB的蛋白稳定性调控。 全文分享可查阅:【国刊之光《STTT》:磷酸化与泛素化碰撞!Trim25靶向降解ITPKB 的能力,被磷酸化水平拿捏,从而触发胶质瘤TMZ耐药】。 #科研#⠂ #分子互作#⠂ #泛素化#⠂ #coip实验#

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